В Азербайджанском педагогическом институте русского языка и литературы им.М.Ф.Ахундова аспирантура была организована в 1962 году после решения Министерства высшего и среднего специального образования. Постановлением Кабинета Министров № 129 от 1 июля 2010 в БСУ была создана Докторантура. С 2011 года прием в докторантуру и диссертантуру по программам доктора философии и доктора наук в Бакинском славянском университете проводится в соответствии с вышеуказанным постановлением. В настоящее время в докторантуре и диссертантуре БСУ обучаются 414 соискателя. Из них: 34 докторанта и 16 диссертантов обучаются по программе доктора наук; 101 докторант и 62 диссертанта – по программе доктора философии. На протяжении многих лет наряду с гражданами Азербайджана в докторантуре также обучались граждане России, Ирана, Казахстана, Турции. В настоящее время в докторантуре БСУ обучаются 15 иностранных граждан. Число исследователей, утвердивших тему диссертации в разные годы – 201. Из них: 38 – аспирантов, 120 – диссертантов и 43 – соискателя, работающих над докторской диссертацией. В Бакинском славянском университете исследования проводятся по следующим специальностям:
5706.01 – Азербайджанский язык
5716.01 – Азербайджанская литература
5718.01 – Мировая литература
5707.01 – Славянские языки
5710.01 – Тюркские языки
5714.01 – Сравнительно-историческое и сравнительно-типологическое
языкознание
5715.01 – Теория литературы
5720.01 – Журналистика
5801.01 – Теория и методика обучения и воспитания
5804.01 – Общая педагогика, история педагогики и образования
5901.01 – Международные отношения
6104.01 – Педагогическая психология
6107.01 – Общая психология
6111.01 – Психология личности
6303.01 – Общая социология
Периодически проводятся встречи выдающихся ученых с докторантами и диссертантами. Докторанты и диссертанты постоянно общаются со своими научными руководителями. Молодые соискатели активно участвуют в научных конференциях, проводимых не только в республике, но и в зарубежных странах – России, Белоруссии, Украине, Словакии, Турции, Франции, Бельгии, Англии, США и др.